A vacinação tem avançado de forma acelerada no país. Em muitos regiões, já estamos vacinando as pessoas na casa dos 30 anos. Apesar disso, ainda deve levar algum tempo até uma parcela considerável da população estar plenamente imunizada.
Inspirado em um tweet que vi a algum tempo, resolvi replicar essa visualização bastante interessante, que mostra a quantidade de vacinados em relação à população por meio de uma pirâmide etária.
Como os microdados da vacinação para todo o país geram um arquivo muito grande, optei por selecionar apenas dos dados do Paraná. Os dados de vacinação estão disponíveis aqui. Seguindo o código abaixo, é possível construir o mesmo gráfico para qualquer um dos estados.
library(tidyverse) library(sidrar) dados = read.csv2("vacina_PR.csv")
Os dados de população serão obtidos por meio da PNAD contínua anual de 2019, com o pacote *sidrar*. Para o gráfico ficar no formato de pirâmide, iremos alterar o valor das mulheres para ser negativo.
piramide = get_sidra(6706, variable = 606, geo = "State", geo.filter = list("State" = 41)) %>% filter(Sexo != "Total") %>% mutate(`Grupo de idade` = ifelse(`Grupo de idade` == "5 a 9 anos", "05 a 9 anos", `Grupo de idade`), Valor = ifelse(Sexo == "Mulheres",-Valor, Valor))
Primeiramente, iremos selecionar apenas as primeiras doses. A mesma visualização pode ser feita para a segunda dose, alterando essa linha. Como os dados de população estão disponíveis por faixas de renda, iremos colocar os dados de vacinação nestas faixas. Assim, agrupamos por faixa de idade e gênero para contar as pessoas. Da mesma forma que fizemos para a população, também iremos tornar a quantidade de mulheres negativa.
dados_g = dados %>% filter(str_replace_all(vacina_descricao_dose, "[^[:alnum:]]", " ") == "1ª Dose") %>% mutate(`Grupo de idade` = case_when(paciente_idade < 5 ~ "0 a 4 anos", paciente_idade > 4 & paciente_idade < 10 ~ "05 a 9 anos", paciente_idade > 9 & paciente_idade < 15 ~ "10 a 14 anos", paciente_idade > 14 & paciente_idade < 20 ~ "15 a 19 anos", paciente_idade > 19 & paciente_idade < 25 ~ "20 a 24 anos", paciente_idade > 24 & paciente_idade < 30 ~ "25 a 29 anos", paciente_idade > 29 & paciente_idade < 35 ~ "30 a 34 anos", paciente_idade > 34 & paciente_idade < 40 ~ "35 a 39 anos", paciente_idade > 39 & paciente_idade < 45 ~ "40 a 44 anos", paciente_idade > 44 & paciente_idade < 50 ~ "45 a 49 anos", paciente_idade > 49 & paciente_idade < 55 ~ "50 a 54 anos", paciente_idade > 54 & paciente_idade < 60 ~ "55 a 59 anos", paciente_idade > 59 & paciente_idade < 65 ~ "60 a 64 anos", paciente_idade > 64 & paciente_idade < 70 ~ "65 a 69 anos", paciente_idade > 69 & paciente_idade < 75 ~ "70 a 74 anos", paciente_idade > 74 & paciente_idade < 80 ~ "75 a 79 anos", paciente_idade > 79 ~ "80 anos ou mais")) %>% group_by(`Grupo de idade`, paciente_enumsexobiologico) %>% tally() %>% filter(paciente_enumsexobiologico %in% c("M", "F")) %>% mutate(n = ifelse(paciente_enumsexobiologico == "F", -n, n), paciente_enumsexobiologico = ifelse(paciente_enumsexobiologico == "F", "Mulheres", "Homens"))
Assim, basta fazer o gráfico de pirâmide etária com dois "geom_bar". O primeiro é o de população, que fica no fundo. Já o segundo é o de dados da vacinação.
ggplot() + geom_bar(data=piramide, aes(y=Valor*1000, x = `Grupo de idade`, fill = Sexo), stat="identity", alpha = 0.4, width=1) + geom_bar(data=dados_g, aes(y=n, x = `Grupo de idade`, fill = paciente_enumsexobiologico), stat="identity", width=1) + scale_fill_manual(values = c("#c23c3c", "#276f9c", "#276f9c", "#c23c3c")) + coord_flip() + theme_classic() + ggtitle("Pirâmide etária de vacinados com a primeira dose no Paraná", subtitle="Com dados do dia 14/07/2021") + scale_y_continuous(labels = abs) + ylab("Número de pessoas")
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